Мусаева Рафика Ганиевна родилась в городе Душанбе в семье служащего. Рафика Мусаева Р. окончила с отличием Таджикский политехнический институт по специальности инженер-электрик.
В 26 лет защитила кандидатскую диссертацию в специализированном Совете Московского института инженеров гражданской авиации и стала первой женщиной-таджичкой — кандидатом технических наук. Работала на кафедре Автоматики и вычислительной техники и одновременно освобожденным секретарем комитета комсомола Таджикского политехнического института.
В течении пяти лет работала Секретарем Центрального комитета комсомола Таджикистана, в дальнейшем в течении трех лет в аппарате Центрального комитета Компартии Таджикистана.
В февраля 1990 году избрана депутатом Верховного Совета республики Таджикистан 12 созыва.
С 1991-1992 Депутат Верховного Совета СССР, член комитета по международным делам Совета Республик.
В ноябре 1992 года на 16 сессии Верховного Совета Республики Таджикистан избрана членом Президиума Верховного Совета Республики Таджикистан, была единственной женщиной в его составе, председателем Комитета по государственному строительству.
Мусаева Р. была членом Конституционной комиссии, членом рабочей группы по разработки новой Конституции Независимого Таджикистана. Ее активная и принципиальная позиция позволила наряду с другими важными вопросами включить в Конституцию ряд правовых норм по защите прав и свобод женщин, детей и семьи.
В 1995 году избрана депутатом Маджлиси Оли РТ первого созыва (парламент страны), на первой сессии которого избрана председателем Комитета по государственному строительству парламента страны.
После принятия Конституции Мусаева Р. выступила инициатором и разработчиком 12 Конституционных законов и 5 законов РТ.
В 1998 году окончила с отличием Академию государственной службы при Президенте РФ, г. Москва, по специальности «юриспруденция», квалификация юрист-специалист по государственному строительству и праву.
В январе 2000 года указом Президента РТ назначена Министром труда и занятости населения РТ, а с января 2001 — Министром труда и социальной защиты населения РТ.
С 2005 года по настоящее время Мусаева Р., являясь организатором и учредителем общественной организации Ассоциации энергетиков Таджикистана, руководит этой организацией.
С мая 2012 по ноябрь 2015 года была директором ГУ «Душанбе-Плаза».
С декабря 2011 года она также возглавила вновь созданную общественную организацию «Женский корпус мира»
Имеет ряд опубликованных научных статей и работ, 4 научно-технические монографии, ряд Аналитических Отчетов и обзоров.
Мусаева Р.Г. заслуженный деятель науки и техники (1994г.), награждена также другими высокими наградами страны: орден «Дусти» (1999), медаль «15 лет 12 сессии Верховного Совета РТ» (2007), медаль «20 лет Независимости РТ» (2011), медаль «30 лет Независимости РТ» (2021).
Она «Отличник народного образования» (2010), «Отличник отрасли труда и социальной защиты» (2021)
Мусаева Р.Г. является членом Общественного совета РТ, членом Национального Совета ИПДО (Инициатива Прозрачности Добывающих Отраслей).